As doenças inflamatórias crônicas que acometem os tecidos periodontais e endodônticos estão entre as mais prevalentes doenças infecciosas, constituindo-se na principal causa de perda dental com implicação significativa ao nível de saúde pública. Nos últimos 15 anos, os avanços no conhecimento da etiologia e do processo de cicatrização das lesões periodontais e endodônticas são decorrentes de pesquisas laboratorias e clínicas, envolvendo metodologias que proporcionaram uma melhor compreensão dos mecanismos celulares e moleculares envolvidos tanto nos processos patológicos, como de regeneração tecidual. Nesse contexto, os dados em larga escala de sequências de DNA, RNA, proteínas e outros metabólitos tem possibilitado a ampliação dos conhecimentos no campo da microbiologia, da imunologia e dos processos biológicos envolvidos na formação e regeneração dos tecidos dentais. Portanto, esse projeto de pesquisa objetiva aplicar as tecnologias de larga escala para: 1) estabelecer novas ferramentas de diagnóstico para as doenças periodontais agressivas e para pacientes que não respondem a terapia endodôntica, 2) definir o microbioma envolvido nas lesões endodônticas-periodontais, 3) descrever as assinaturas de expressão gênica e proteica dos tecidos/células periodontais, 4) identificar moléculas chaves no controle da formação das estruturas periodontais, e 5) aplicar os conhecimentos adquiridos nos objetivos anteriores, de forma a definir novas abordagens terapêuticas para promover a reconstrução dos tecidos periodontais e endodônticos. Vale ressaltar que, dentro dessa temática, o PPGCO já possui intercâmbios com instituições estrangeiras com financiamentos à pesquisa vigentes tais como: 1)Acordo de Cooperação – University of Birminghan & University of Nottinghan (Processo FAPESP # 2017/07944-5) e 2) chamada OSU (Ohio State University) / Fapesp (Processos # 2015/50248-4 e # 2015/50264-0).